Une bonne doc pour installer etherpad-lite sur une debian (wheezy), pour jessie c'est un peu plus simple.
Pour faire d'etherpad-lite un service : https://github.com/ether/etherpad-lite/wiki/How-to-deploy-Etherpad-Lite-as-a-service
Pour réaliser un reverse proxy : https://github.com/ether/etherpad-lite/wiki/How-to-put-Etherpad-Lite-behind-a-reverse-Proxy